IKEZH drejtohet nëpërmjet Bordit Drejtues, si organi më i lartë vendimmarrës, dhe Drejtorit Ekzekutiv, si organi më i lartë ekzekutiv dhe përfaqësuesi ligjor i organizatës.
Bordi Drejtues
Bordi Drejtues përcakton fushat dhe programet e veprimtarisë, miraton politikat e përgjithshme, shqyrton raportet financiare dhe merr vendimet kryesore mbi strukturën dhe zhvillimin e organizatës.
Drejtori Ekzekutiv
Dr. Albert Gjoka
Drejtor Ekzekutiv dhe përfaqësues ligjor.
Dr. Albert Gjoka
Drejtor Ekzekutiv dhe përfaqësues ligjor